Немного графиков про covid-19

Единственное, о чем можно написать пост в апреле 2020 - это, естественно, эпидемия. Ну и, конечно, самоизоляция добавляет возможности посидеть дома, рисуя всякие графики в R.

Посмотрим сегодня на то, как выглядят данные по заболеванию в разных странах. Cвоя рубаха ближе к телу\моя хата с краю или что-там ещё, поэтому интересно будет взглянуть похожа ли ситуация в России на другие страны.

Для построения всех графиков использовались данные отсюда, которые в свою очередь взяты из отчетов европейского центра по предотвращению и контролю заболеваний (ECDPC) и из отчетов ВОЗ. Данные о количестве проведенных тестов взяты с официальных сайтов национальных медицинских организаций.

Данные были актуальны на 7 апреля 2020!

Важное замечание по данным о количестве проведенных тестов. В официальных источника почти нигде не указывается идет ли речь о количестве тестов  или о количестве протестированных людей. Из-за этого многие сравнения могут оказаться некорректными.

Еще одно важное замечание - можно попытаться выделить в данных какие-то общие тенденции, похожие между собой страны и т.п., но нужно помнить, что стратегии тестирования (всех подряд/только с симптомами), стратегии госпитализации (всех с симптомами/с осложнениями), доля городского населения, уровень развития и доступности мед помощи и еще множество факторов влияют на распространение заболевания. К любым выводам, сделанным без учета этих факторов, стоит относиться критически.

Итак, пора рисовать картинки. Будем рассматривать только страны с количеством подтвержденных диагнозов на 7 апреля больше 5 тысяч, чтобы не загромождать графики.

Посмотрим для начала на то, как меняется число новых ежедневных подтвержденных случаев заражения со временем. Для этого на каждый день посчитаем отношение числа новых случаев к числу в предыдущий день и посмотрим на среднее. Для стран, где оперативно приняты эффективные меры против распространения заболевания (например, Южная Корея), мы должны увидеть меньшую скорость роста заболеваний. То же и для стран, которые справились с эпидемией (на 7 апреля можно сказать так только, пожалуй, о Китае). Что, собственно, и видно на графике.

Россия, как видно, в числе стран с очень низкой скоростью роста и при этом в начале временного периода. Индия и Швеция не далеко, но там очень маленький охват тестирования. Канада, если верить интернетам, среди стран, у кого был опыт борьбы с эпидемией в прошлом и они оперативно предприняли нужные меры (Австралия будет непохожа на большинство других стран и по остальным критериям. Быстрый поиск возможных причин оказался безрезультатным ¯ \ _ (ツ) _ / ¯ ).

Взглянем теперь на то, как соотносится количество подтвержденных случаев с объемом тестирования. Логично ожидать что-нибудь похожее на линейную зависимость:

Из значительно отклоняющихся примеров Корея  и Канада (о возможных причинах см. выше). Снова видим Австралию, как и положено вдали от остальных материков. Ну и Россию.
Посмотрим на процентное отношение числа умерших к числу подтвержденных случаев:

Интересно колоссальное различие между двумя соседствующими странами -Италией и Германией (добавим стереотипов: педантичность немцев и разгильдяйство итальянцев?).
Россия в окружении стран с самой низкой смертностью.
Ну и в завершении взглянем на скорость тестирования как на количество тестов от начала роста заболеваемости:

По скорости тестирования мы уступим разве что Турции.
В целом, мы в лидерах по низкой скорости роста заболеваемости, низкой смертности и высокой скорости тестирования :) ¯ \ _ (ツ) _ / ¯
Соблюдайте социальное дистанцирование, оставайтесь дома и не болейте :)